Jessenius lääketieteellisen tiedekunnan valintakoe on osa Comenius-yliopistoa. Valintakoe suoritetaan kirjallisena (vuonna 2024 sähköisessä muodossa). Koe sisältää biologian ja kemian monivalintakysymyksiä, joilla on vain yksi oikea vastaus. Parhaat tulokset saaneet hakijat hyväksytään tiedekuntaan. Tiedekunta tarjoaa opetusohjelmia valintakoetta varten (kysymyksistä ei siten ole tietokantoja, kuten Kosicessa ja Bratislavassa).

Valintakokeeseen ilmoittautumiseksi tarvittavat asiakirjat: on vain täytettävä ilmoittautumislomake ja liitettävä kaikki tarvittavat asiakirjat (passi, akateemiset asiakirjat, CV). Onnistuneen valintakokeen jälkeen asiakirjat on toimitettava myös paperisena: käännökset akateemisista asiakirjoista, todistus hepatiitti B -rokotteesta, terveystodistus ja 3 passikokoista kuvaa.